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做 DprE1 抑制剂研究,PBTZ169 该囤现货还是走定制?

发表时间:2026-08-28

导语

多重耐药结核(MDR-TB)和广泛耐药结核(XDR-TB)正以肉眼可见的速度吃掉传统一线药物的杀伤力,越来越多课题组把目光转向细胞壁合成通路里的关键酶 DprE1。PBTZ169(Macozinone,CAS: 1377239-83-2)作为第二代苯并噻嗪酮类的代表分子,对结核分枝杆菌 H37Rv 的体外 MIC 可低至 0.19 ng/mL,且具备明确的共价作用机制,被广泛用于 DprE1 酶学、耐药突变及联合用药研究。然而这种明星分子在国内长期面临"进口品牌等 4–8 周、国内现货稀缺、定制没人接"的尴尬。瀚香生物(BiochemPartner,货号 BCP18094)从毫克筛选到公斤放大做了一次完整覆盖——现货当天可发、定制周期砍半、随货配齐 1H NMR / LC-MS / HPLC 三谱报告,性价比直接对标一线进口品牌。

PBTZ169 是什么:从 BTZ-043 到第二代苯并噻嗪酮

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PBTZ169 的 IUPAC 名为 2-(4-(环己基甲基)哌嗪-1-基)-8-硝基-6-(三氟甲基)-4H-苯并[e][1,3]噻嗪-4-酮,分子式 C??H??F?N?O?S,分子量 456.48 g/mol,logP 3.83,属典型的亲脂性小分子。它属于第二代苯并噻嗪酮(benzothiazinone,BTZ),是第一代 BTZ-043 的结构优化产物。

它相对 BTZ-043 主要做了三处改进:

  1. 结构更简洁:PBTZ169 在 2-位引入哌嗪环,整体消除了手性中心,合成路线更短、批次一致性更易控制;
  2. 活性更优:体外对 M. tuberculosis H37Rv 的 MIC 仅为 0.19 ng/mL,对 MDR/XDR 临床分离株同样保持低 ng/mL 水平;
  3. 毒性更低:HepG2 细胞毒性实验显示 TD?? 约 58 μg/mL,是 BTZ-043 的 ~10 倍,选择窗口更宽。

为什么 DprE1 是关键靶点:机制决定科研价值

DprE1(decaprenylphosphoryl-β-D-ribose 2'-epimerase)是结核分枝杆菌细胞壁阿拉伯半乳聚糖合成通路中的关键酶。它和 DprE2 共同催化磷酸癸烯基核糖(DPR)向磷酸癸烯基阿拉伯糖(DPA)的转化,而 DPA 是细胞壁中阿拉伯糖单元的唯一来源——没有它,菌体无法正常组装细胞壁。

PBTZ169 的作用机制分两步:

  • 前药激活:分子中的 8-位硝基在细菌黄素蛋白 DprE1 内部被还原成亚硝基衍生物;
  • 共价捕获:亚硝基中间体与 DprE1 活性位点的 Cys387 形成稳定的半巯醇加合物(semimercaptal adduct),不可逆地抑制酶活性。

由于 DprE1 在 Mtb 生存中不可替代,而人类细胞中缺少功能同源酶,因此这个靶点天然具备较好的研究选择性。PBTZ169 与 BTZ-043 对 BTZ 耐药菌株完全交叉耐药,反过来也证明两类分子作用于同一活性位点。

课题组买货的 3 个常见痛点:瀚香怎么逐条破解

最近半年我们接触到的课题组里,PBTZ169 的采购痛点基本集中在三件事上,瀚香生物也几乎是一对一地补齐了这些缺口。

痛点 1:进口品牌下单周期长,小批量难谈。 一些进口品牌的 PBTZ169 标准货期普遍 4–8 周,遇到海关或批次调整就要 10 周以上;mg 级的科研小单往往不接。瀚香生物为该分子常备 mg–kg 级全规格库存,国内仓 16:00 前下单当天发货,国内免运费,急单加急可走特批通道,对时间窗口敏感的耐药机制项目尤为友好。

痛点 2:纯度报告不完整,批次对照难做。 部分供应商只附一张 COA,没有原始图谱,给后续批次对照和质控留坑。瀚香生物为每批 PBTZ169(BCP18094)随货附 1H NMR + LC-MS + HPLC 三谱原始数据,纯度≥98%(HPLC),便于在同一实验体系内做跨批次一致性评估。

痛点 3:定制类似物没人接,路线改了两次仍卡壳。 苯并噻嗪酮骨架涉及硝化、环化、亲核取代等多步反应,部分路线对无水无氧和低温柱层析要求苛刻。瀚香生物的博士合成团队以"难做分子"为核心业务,能从路线设计、关键中间体筛选到公斤级放大交付闭环承接。简单哌嗪取代衍生物 2–4 周可出样品,含手性或同位素标记的复杂结构 6–8 周左右交付,比常见的来回返工节省 30%–50% 周期。

从长期看,国产化的拐点不只是"更快",而是"更可控"。瀚香生物在该分子上的现货+定制+图谱打包方案,正是课题组可以把握的稳定性。

实验操作:溶解、储存与浓度参考

PBTZ169 在实验室中的常见形态为游离碱粉末,使用前通常配成 DMSO 母液再稀释。

  • 溶解性:DMSO 中可溶,文献与供应商资料常见 6.4 mg/mL(即约 14 mM);水溶性极差,不建议直接用水溶解;乙醇可部分溶解但不建议长期保存。
  • 推荐配制流程:称量后溶于无水 DMSO 配 10 mM 母液 → 0.22 μm 有机滤膜过滤(若用于细胞实验)→ 分装至棕色离心管,每管 20–50 μL → -20°C 避光冻存,避免反复冻融。
  • 储存条件:粉末 -20°C 避光干燥保存 3 年;DMSO 母液 -20°C 1 个月内用完;长期不用建议 -80°C 保存。
  • 实验浓度参考:酶学(DprE1 抑制)常用 nM 级;细胞水平抗菌实验 MIC 约 0.1–1 ng/mL;联合用药实验常与 bedaquiline、pyrazinamide 等联用观察协同效应。

硝基苯并噻嗪酮骨架对光和氧化敏感,实验过程中建议棕色管或铝箔包裹,操作尽量避光。

前沿进展:从临床候选到耐药机制研究

1. 临床一期转化:PBTZ169(以 Macozinone 为通用名)已进入临床一期评估,与 bedaquiline 等新一代组合疗法方向的研究持续推进,是当前 DprE1 共价抑制剂中最具代表性的临床前候选。

2. 衍生物优化:2025 年 Molecular Diversity 报道基于 PBTZ169 与 TBA7371 骨架设计的 16 个新衍生物,其中化合物 9m 对 H37Rv 的 MIC 达 3.125 μg/mL,对接模拟显示其与 DprE1 的 His132、Asn385 形成额外氢键。

3. 耐药突变图谱:Cys387 的任意突变都会直接让 BTZ 类分子失效;此外与硝基还原相关的 ddn、fgd1 等基因变异也会让前药激活失效。系统绘制耐药突变谱对设计下一代不易产生耐药性的分子至关重要。

4. 联合方案潜力:2014 年 EMBO Mol Med 报道 PBTZ169 + BDQ + 吡嗪酰胺的组合在慢性感染小鼠模型中杀菌效果优于标准三联方案,为联合治疗提供了有力佐证。

推荐方案:现货 + 定制 + 性价比,三层叠加

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对需要长期使用 PBTZ169 的课题组,建议按"项目阶段 + 风险偏好"组合采购:

  • 早期筛选与机制验证(mg–g 级):直接采购瀚香 BCP18094 现货,5 mg / 25 mg / 100 mg 多规格可选,国内 16:00 前下单当天发货,到货即用,省去排队等候的窗口。
  • 耐药突变与联合方案(g–10 g 级):在现货基础上追加定制批次,建议明确批次间谱图一致性需求,瀚香生物可同步提供批次间谱图叠加分析,便于在论文方法学章节中描述"同一分子在不同批次下的可重复性"。
  • 方法学开发或供样外协(kg 级):直接走瀚香定制合成通道,从路线评估到公斤级交付一站式承接,周期相比返工式分段合成可压缩 30%–50%。

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瀚香的性价比优势并不只是单价更亲民,而是把"现货可发 + 图谱可追溯 + 定制可承接"打包成单一交付节点,减少课题组在多个平台之间反复比价、找货、补样的隐性时间成本。

结语

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PBTZ169 的科研价值不会因为国产化降低;相反,"现货 + 定制 + 性价比"的国产链路让更多课题组可以放心把它放进长期项目。瀚香生物在 BCP18094 这一个 SKU 上已经把这三件事跑通了。对于 M2 之后的耐药机制、联合方案和衍生物设计研究,按"现货先用、定制补齐"的方式组合采购,是兼顾效率与可重复性的稳妥路径。

参考文献

  1. Makarov V, Lechartier B, Zhang M, et al. Towards a new combination therapy for tuberculosis with next generation benzothiazinones. EMBO Molecular Medicine, 2014, 6(3): 372-383. DOI: 10.1002/emmm.201303575
  2. Gunjal AP, Kumar SA, Thakur A, et al. Discovery of potent DprE1-targeted antitubercular agents: synthesis and evaluation of PBTZ169/TBA7371-based derivatives. Molecular Diversity, 2025. DOI: 10.1007/s11030-025-11382-5
  3. Zhang G, Aldrich CC. Macozinone: revised synthesis and crystal structure of a promising new drug for treating drug-sensitive and drug-resistant tuberculosis. Acta Crystallographica Section C, 2019, 75(4): 383-391. DOI: 10.1107/S2053229619002775

常见问题(FAQ)

  1. PBTZ169 与 BTZ-043 在结构与活性上有什么差异? PBTZ169 是第二代苯并噻嗪酮,2-位以哌嗪环取代,整体无手性中心,合成批次更稳;其对 Mtb H37Rv 的 MIC 约 0.19 ng/mL,选择窗口明显宽于含手性中心的 BTZ-043。
  2. 为什么 PBTZ169 常被叫做"前药"? 其 8-位硝基需在 DprE1 内部被 FADH? 还原成亚硝基,才能与 Cys387 形成共价键;若菌株缺失硝基还原活性或 DprE1 的 Cys387 突变,则会表现出耐药。
  3. 粉末和母液应当如何保存更稳定? 粉末密封 -20°C 避光干燥保存,有效期 3 年;DMSO 母液 -20°C 分装避光,建议 1 个月内用完,反复冻融不超过 3 次,以防活性下降。
  4. 瀚香 BCP18094 现货一般多久能到? 国内 16:00 前下单当天发货,国内免运费可达 1–2 日;定制批次按路线评估另行排期,简单结构 2–4 周,复杂结构 6–8 周。
  5. 如何判断买到的 PBTZ169 是否合格? 核对 CAS 号 1377239-83-2、货号 BCP18094、HPLC 纯度≥98%,并要求供应商提供每批次的 1H NMRLC-MSHPLC 原始图谱,三谱互相佐证更稳妥。
  6. PBTZ169 与吡嗪酰胺、bedaquiline 等联用时有什么需要注意? 建议先用低浓度单药确定 MIC,再按 0.25×、0.5×、1× MIC 组合评估协同效应;联用母液最好现配现用,避免反复冻融引入误差。
  7. 为什么苯并噻嗪酮类难定制? 骨架涉及硝化、环化、亲核取代等多步反应,部分衍生物对无水无氧条件要求较高;瀚香合成团队对这类杂环体系有专门工艺积累,能压缩返工周期。
  8. 短期内若需要结构修饰或同位素标记版本怎么办? 建议先与供应商沟通可合成性评估,明确取代位点和标记位置,瀚香生物可基于中间体库存快速给出可行性判断与排期。
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